1999年初，時任行政院經濟建設委員會的江丙坤主任委員，鑑於台灣經濟面臨轉型升級的挑戰，除了政府應有長遠的戰略規劃及戰術措施外，仍須透過民間各大企業的積極參與配合，方可奏功，於是經多方奔走倡議，終獲致高層的認可以及工商企業大老的支持，乃於1999年7月在台北成立「中華民國三三企業交流會」(以下簡稱三三會)。由當時德高望重的工商大老辜振甫先生當選首任理事長，工商協進會理事長辜濂松等3人擔任副理事長。嗣辜濂松董事長、江丙坤董事長及許勝雄董事長分別先後於2003年、2012年及2018年接任理事長。

現任三三會理事長係由台玻集團林伯豐董事長於2021年8月接任，副理事長則分別由台聚企業團吳亦圭董事長、大成長城企業團韓家宇董事長及中信企業團東京之星銀行黃清苑董事長擔任。目前三三會會員有77家企業團，55家贊助會員，全部會員營收淨額已超過7,000億美元。

為培養新一代年輕企業家，本會並以「傳承、交流、創新」的理念，於104年10月成立青年企業家委員會(簡稱「三三青年會」)，冀能經由企業優秀文化之傳承與交流，促進創新思維及腦力激盪，締造新商業模式，進而強化企業國際競爭力，為企業之永續經營注入活力。現任會長為耐斯集團陳冠舟副董事長，委員人數114位。

三三會會員在如此堅強陣容的支柱基礎上，將以回饋社會、貢獻國家，共同為推動國際經貿關係及企業的茁壯發展而邁進。